Потому что, например, History++ и NewStory реализуют не только журналы, но и окно истории.
А в Миранде одновременно не может быть двух плагинов, реализующих сервис окна истории. Если врубить History++, то принудительно вырубаются все прочие, кто тоже предоставляет сервис истории: NewStory, StdHistory, BasicHistory, IEHistory.
Кроме того, Миранда придерживается философии "по возможности выносить всё в плагины". Например, зачем мне в ядре этот IEView, если я пользуюсь совсем иным журналом?
Тем более, что в будущем, надеюсь, мы выбросим и IEView (неустранимый недостаток: после смерти флеша не в состоянии показывать видео), и History++ (неустранимый недостаток: написан на Паскале), как только втащим в NewStory поддержку HTML. И тогда вариантов станет поменьше: либо скудный встроенный журнал плагина сообщений (TabSRMM, StdMsg, Scriver), либо NewStory со всеми прелестями HTML5.