То есть, ставите галку на AdvancedAutoAway, перезапускаете Миранду, появляется в дереве настроек AutoAway, а Idle пропадает.
Так и было в development-версии после обновления, но статусы ставились независимо от того, делалось что-то за компьютером или нет, просто по времени - прошло 5 минут и idle, прошло еще 10 - установился N/A, но снимались обратно только вручную.
В стабильной версии Idle и AdvancedAutoAway сосуществуют, но с надписью в настройках AdvancedAutoAway, что она работать не будет, т.к. в Idle включена смена статуса. Это я и не заметил поначалу, и после очередного обновления начались такие глюки - получается смена статуса в Idle была включена, но не работала.
Возможно что-то лишнее бекпортировалось в стаблю...
Скорее всего, так и случилось, но зато хотя бы можно отключить в Idle смену статуса, которая мешала работать AdvancedAutoAway.