Rostix, поясню на собственном примере. Часто одновременно у меня запущенно 3 миранды на моих компьютерах. Когда сообщение приходит с сервера без выставленной опции "Mark read on reply", то оно падает во все три истории, но на одной из моих машин из-за особенностей сетевого подключения, оно падает уже прочитанным. То есть сидя за ней я могу и не узнать, что сообщение пришло, поскольку ему выставила признак "прочтено" какая-то другая миранда, или клиент на планшете или телефон. Эта опция проблему решает.